En 2002 fue reclutado por el Bayern Múnich, para jugar en la filial, equipo con el que ganaría la Regionaliga Sur, siendo el máximo goleador del campeonato con 21 goles. Si bien tuvieron una luz de esperanza a partir de las fechas 20 y 21, la caída ante el campeón del certamen, Deportes Temuco los devolvió a la realidad del peligro de descenso, especialmente después de que los equipos que venían de más atrás empezaran a ganar partidos y obtener puntos importantes en su lucha por salvar la categoría. En la primera etapa se jugaron 18 fechas bajo el sistema de todos contra todos, al término de los cuales los cuatro primeros avanzaron a semifinales donde se enfrentaron en partidos ida y vuelta. El 25 de julio de 2012, hizo su debut en un partido contra el Cruzeiro en el Brasileirão 2012, donde entró por primera vez en la Liga Brasileña, por Emerson Sheik, el Corinthians ganó por 2-0. Su debut en el «Timao», atrajo la atención inmediata de los medios de comunicación del Perú a Sao Paulo. En abril de 2010 el depredador recibió una multa del club por un incidente al final de un partido de liga con el Hannover 96, donde, después de haber sido insultado por un fan del Hamburgo, Guerrero le lanzó una botella de agua que le golpeó en el rostro.
Los siguientes meses son para el Granada meses de incertidumbre, como para el resto de equipos, ya que, se desconocía si se podría disputar lo que quedaba de liga, lo que hubiese supuesto un palo económico muy grande para todos los equipos de la competición, que iban a ver disminuidos sus ingresos por derechos de televisión, así como los de los patrocinadores. La primera edición del Campeonato de Guipúzcoa (1918-19) la disputaron 4 equipos Izarra de Eibar, CD Esperanza, Real Unión y Real Sociedad. La primera fue el 10 de marzo de 2002 ante Melgar. A comienzos de la temporada 2008-09, Guerrero se había convertido en el delantero de primera elección para el Hamburgo S.V. En esa misma temporada en que fue nombrado capitán, se consagró máximo goleador de la Eredivisie, con 35 tantos en 33 partidos y obtuvo el récord de ser el jugador extranjero con más goles en una temporada en la liga de los Países Bajos. Los cocineros del mar saben que estos animales preciosos sólo deben servirse asados o fritos. Durante la temporada 2014 fue distinguido como el mejor delantero del Brasileirao, obteniendo el Balón de Plata de la liga Brasileña y siendo incluido en el equipo ideal.
La IFFHS lo incluyó en el equipo ideal sudamericano de la última década, siendo reconocido como el mejor centrodelantero sudamericano entre los años 2010-2020 (integrando el podio junto a Neymar y Sergio Agüero). Reseña del equipo en la FIFA Archivado el 9 de diciembre de 2012 en Wayback Machine. Debido a sus destacadas actuaciones, fue ascendido por Jaime Duarte al primer equipo en julio del año 2001, junto a Jefferson Farfán, aunque, a diferencia de este y estando convocado en lista de jugadores como suplente, camiseta del valencia 2025 no entró a jugar un partido oficial con camiseta blanquiazul. Con la camiseta 22 pudo hacer su debut con la blanquiazul en Matute, pero se quedó en banca en el triunfo por 3-1 ante Melgar. 1991 a los siete años de edad, esto hizo posible que realice toda su etapa formativa en las divisiones menores del club blanquiazul. Cerca del final, Guerrero anotó tres goles, por lo que acabó la temporada con un total de cinco goles en 20 partidos. Perú desde 2004, siendo, hasta la fecha, el máximo goleador histórico con 40 tantos y el tercero con más partidos. En muchos partidos se le ha visto mirando a la tribuna, con lágrimas en los ojos, buscando a su mamá Peta.
En 2017 se convirtió en el futbolista mejor pagado de Sudamérica, ganó el Campeonato Carioca, donde fue reconocido como mejor jugador y máximo goleador, siendo incluido en el equipo ideal. A mediados de 2006 dejaría el Bayern para pasar a las filas del Hamburgo con el que consiguió una Copa Intertoto de la UEFA en 2007. Dejaría el equipo tras 6 temporadas consolidado como el quinto máximo goleador extranjero en la historia del club, con 51 goles. Finalmente la selección chilena clasificó a la cita mundialista luego de vencer 4-2 a Colombia en Medellín, Sánchez no jugó este partido debido a que estaba suspendido. El combinado nacional cerraba una discreta actuación mundialista al que llegaba como una de las mejores selecciones existentes y se volvía a casa antes de tiempo en la que sería su peor participación en un Mundial hasta la fecha, sin alcanzar la fase final, un hecho que sí consiguió tras terminar en 5.ª y 4.ª posición en las ediciones anteriores.
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